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紅麴具有降低血脂、降低膽固醇（尤其是LDL，低密度脂蛋白膽固醇）、降血壓、降血糖、防癌、預防老人癡呆等功效。
如今，全世界的科學界投入大量針對紅麴健康效果的研究，尤其以台灣大學的潘子明教授研究最為突出與透徹，市場上各種紅麴膠囊、大紅麴、紅麴納豆等產品發展迅速，所以台灣在研究紅麴的科學與應用方面，在全世界看來都算是非常突出的成就，相當值得台灣驕傲。紅麴也常與納豆萃取物或是魚油組合為保護心血管的保健配方。